本文首先分别对企业的内部控制审计与财务报表审计的含义、起源及其发展进行了整体性的概述，目的是对两者的具体概念及其发展概况进行大致的了解，为接下来进一步分析两者的关系做好理论准备。

其次，本文对两者的异同进行了具体的分析，发现两者虽然在审计对象等属性上存在着实质性的差异，但是在审计程序等技术层面和实务工作中有着许多共同点。而正是因为两者在实际的工作中有许多的工作是重合的，所以这为内部控制审计与财务报表审计的整合提供了理论可能。

在分析了两者整合的可能性后，本文探讨了两者进行整合的意义和重要性。并进一步介绍了整合审计的具体流程。本文同时也指出，将内部控制审计与财务报表审计进行整合，虽然可以提高注册会计师的工作效率，降低审计成本以及提高审计质量，但是在进行整合审计的过程中，仍可能出现一些不可避免的问题。如何能够更好的完成整合审计的工作，这需要注册会计师与企业管理层的共同努力，如：注册会计师在设计审计计划时要全面，进行审计程序时要及时进行控制测试等；企业的管理层要意识到整合审计的重要性，提供真实有效的内部控制信息。

本文主要分析了内部控制审计与财务报表审计的异同，发现两者整合的可能性。在审计工作的过程中，将两者进行整合既可以减轻注册会计师的工作量，提高工作效率；又可以提高审计质量，因此将两者进行整合是十分必要的。内部控制审计与财务报表审计的整合审计应当被注册会计师及企业所重视，大力发展两者的整合审计，可以为企业提供更加有效的审计服务。而在这一过程中，企业与注册会计师应多加沟通，制定更加有效地审计计划，以便更好地完成审计工作。我国政府也应当大力倡导内部控制审计与财务报表审计的整合，以促进我国审计业务的更好发展。