在生物学分子网络图中，图注说明不同形状分子的属性，每个节点代表一个分子，图中灰色分子为紫杉醇的靶蛋白或乳腺癌的相关基因，未涂色的分子为构建分子网络所需要的相关分子。实线代表靶蛋白和乳腺癌相关基因间直接的作用关系，虚线代表两个分子之间间接的作用关系。通过IPA构建的生物学分子通路，可以显示分子之间的作用功能，体现生物功能的复杂多样性。

从上述由乳腺癌相关基因和紫杉醇对应靶蛋白构成的分子网络图，可以看出构成乳腺癌基因网络的分子，多与细胞运动、蛋白质合成、皮肤疾病和条件、心脏疾病、类脂化合物代谢作用、神经系统和听觉、前庭的发展和功能，以及有机体的损伤和异常；而构成紫杉醇靶蛋白网络的分子，则与癌症，有机体损伤及异常，再生系统的疾病，细胞的增长、增殖及其凋亡，细胞妥协以及DNA的复制、重组以及修复。由此可以说明，二者所构成的生物学分子网络，既有共同的分子也有差异的分子，而各自的生物功能复杂多样。

紫杉醇靶蛋白和乳腺癌相关基因生物学通路的比较

运用Network Analysis建立分子网络通路之后，通过IPA软件中的Comparison Analysis中的Canonical Pathway模块进行分析比较，对比紫杉醇对应靶蛋白和乳腺癌相关基因作用的生物学通路，从中发现二者共同作用的通路78条，对其共同作用的通路进行分类，其中有两类通路与癌症相关，分别是22条癌症信号相关通路（图3）以及7条凋亡相关通路（图4）。

图3中，乳腺癌基因和紫杉醇靶蛋白共同作用的癌症相关信号通路中主要涉及Stathmin1乳腺癌的调控通路、组织因子在癌症中的作用通路、药物外排对癌症的耐药性通路、HER-2乳腺癌信号通路。

图4中，二者共同作用的凋亡通路涉及14-3-3介导信号转导通路、H1V1凋亡引入通路、介导的凋亡信号通路、凋亡信号通路、SAPK/JNK信号通路、端粒酶信号通路、芳基烃受体信号通路。通过以上结果分析，紫杉醇(Paclitaxel)主要作用于癌症的信号通路和凋亡通路，紫杉醇有可能是通过调节这些通路来对乳腺癌进行治疗......

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本文基于生物信息学数据库和工具，对紫杉醇靶蛋白和乳腺癌相关基因构建生物分子网络及通路，并比较二者共同生物学通路及共同作用位点，探究紫杉醇治疗乳腺癌分子机制。研究发现，紫杉醇可通过干预乳腺癌相关的凋亡通路和癌症信号通路上多个位点以达到治疗乳腺癌的作用，如紫杉醇发挥着影响微管蛋白聚集的作用，主要在与共同通路中的微管蛋白（Tubulin）和β整合素（β-Integrin）等作用位点，从而阻滞细胞的增殖和分裂，抑制抗凋亡作用。本文研究为药物靶向治疗、天然药物对乳腺癌等恶性疾病的治疗等提供了新的思路和研究方向。